Mikroba pathogen adalah: mikroba yang apabila setelah ditelan atau dikonsumsi dapat menimbulkan atau menyebabkan penyakit. Pada umumnya mikroba pathogen bila tertelan atau dikonsumsi akan terjadi yang namanya keracunan atau infeksi, dan perlu diketahui bahwa keracunan dan infeksi ini walau mempunyai akibat yang sama yaitu sama-sama menimbulkan penyakit, namun memiliki artian yang berbeda. Dan berikut ini adalah penjelasan singkat tentang keracunan dan infeksi secara mikrobiologi.
Keracunan; dapat terjadi karena tertelannya suatu racun yang berasal dari komponen anorganik(sianida), racun organic(gosipol, visin etc..) atau yang berasal dari hewan (skrombotoksin, tetrodotoksin, etc…) , keracunan juga dapat terjadi akibat tertelannya toksin yang merupakan metabolism sel-sel mikroorganisme tertentu yang disebut sebagai intoksikasi.
